Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
ANKRD54Q6NXT1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms