Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF544Q6NX49 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms