Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOBEC3HQ6NTF7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms