Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRNP1Q6NT89 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRNP1Q6NT89 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms