Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KRT80Q6KB66 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms