Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AGAP6Q5VW22 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP6Q5VW22 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms