Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GKAP1Q5VSY0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms