Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms