Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HP1BP3Q5SSJ5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms