Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C9orf116Q5BN46 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms