Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF2Q5BJF6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF2Q5BJF6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms