Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PAN3Q58A45 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PAN3Q58A45 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms