Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACTBL2Q562R1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms