Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.56
CDCA8Q53HL2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCA8Q53HL2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms