Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PDLIM3Q53GG5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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