Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C4orf17Q53FE4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms