Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTXN3Q4LDR2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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