Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP27-1Q3LI81 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP27-1Q3LI81 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms