Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
KRTAP20-2Q3LI61 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms