Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC96Q2M329 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms