Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPP1Q16831 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPP1Q16831 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms