Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ECM1Q16610 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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ECM1Q16610 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ECM1Q16610 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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