Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDC37Q16543 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDC37Q16543 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms