Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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ZNF56Q15929 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZNF56Q15929 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZNF56Q15929 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
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