Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USF2Q15853 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF2Q15853 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF2Q15853 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
USF2Q15853 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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