Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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EFNB3Q15768 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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EFNB3Q15768 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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EFNB3Q15768 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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EFNB3Q15768 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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EFNB3Q15768 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB3Q15768 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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