Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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