Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RABEP1Q15276 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABEP1Q15276 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms