Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCLAFQ15004 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PCLAFQ15004 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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