Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFTN1Q14699 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms