Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SQLEQ14534 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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