Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLF9Q13886 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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