Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ALCAMQ13740 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALCAMQ13740 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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