Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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