Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CUL4BQ13620 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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