Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MTMR3Q13615 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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