Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PEX6Q13608 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PEX6Q13608 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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