Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC1Q13547 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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