Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C1orf61Q13536 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C1orf61Q13536 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms