Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NAB1Q13506 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms