Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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MKRN4PQ13434 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MKRN4PQ13434 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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