Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
UBE2V1Q13404 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
UBE2V1Q13404 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms