Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF6Q13247 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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