Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFT88Q13099 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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