Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIK3Q13003 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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