Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GRIK2Q13002 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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