Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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