Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TP53BP1Q12888 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms