Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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NFIAQ12857 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFIAQ12857 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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NFIAQ12857 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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