Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
STX4Q12846 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
STX4Q12846 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms